我校计算机与人工智能学院硕士研究生刘峻江作为第一作者在人工智能领域中科院SCI二区、Top期刊《Applied Soft Computing》上发表题为“Parallel convolutional and Transformer encoder method for cancer related T cell receptor sequences prediction”的学术论文,其导师周树森副教授为通讯作者。
首先,该研究使用词向量来表示受体序列中的氨基酸,与其他方法相比,这增强了特征提取的能力。在模型方面,采用不同注意力头的并联Transformer编码器捕获多维TCR-seq特征,与CNN的融合进一步加强了特征提取能。其次,该研究从TCR-seq中去除不必要的氨基酸,并通过将序列填充到统一长度来解决数据集利用率低的问题。最后,通过对所提出方法的可解释性分析,该研究发现谷氨酸、脯氨酸和酪氨酸在识别癌症相关的TCR-seq中发挥了关键作用,这对后续研究者探索受体的免疫机制具有重要意义。(计算机与人工智能学院 通讯员:周树森)
